Άγιος Νικόλαος / Άγιος Σεραφείμ

Μέσα στον αρχαιολογικό χώρο της βόρειας κλιτύος, βρίσκονται τα εναπομείναντα αρχιτεκτονικά μέλη του ναού του Αγίου Σεραφείμ. Ο ναός χρονολογείται κατά την πρώτη περίοδο της Οθωμανικής κατοχής και ανήκει στον αρχιτεκτονικό τύπο του εγγεγραμμένου σταυροειδή ναού με τρούλο. 

  Βρίσκεται  σε μικρή απόσταση από την οδό Θεωρίας και τον μεσοβυζαντινό ναό της Μεταμορφώσεως του Σωτήρος και αποτελεί την πρώτη στάση μετά την είσοδο των επισκεπτών στον αρχαιολογικό χώρο.